🔬 Scientific Agent Skills:137 个科研 AI 技能,把任何 Agent 变成科研助手
> 来源: https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
> 日期: 2025-10-19 创建,2026-05-15 报告
> 作者: K-Dense Inc.
一句话版本
一套 137 个即插即用的科研 Agent 技能(SKILL.md),覆盖生物信息学、药物发现、临床研究、物理、材料、金融等 17+ 领域,任何支持 Agent Skills 标准的 AI 工具(Cursor、Claude Code、Codex)都能直接用。
核心内容
这是什么?
K-Dense 公司维护的最大科研 Agent 技能集合。每个技能是一个 SKILL.md 文件,包含:
- 完整文档(API 用法、最佳实践)
- 可执行代码示例
- 使用案例和工作流模板
安装方式极其简单:
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
# 或者
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills
然后你的 Agent 会自动发现并使用这些技能。
仓库规模
| 指标 | 数字 |
|---|---|
| ⭐ Stars | **21,899** |
| 🔀 Forks | 2,386 |
| 📦 Skills | **137** |
| 🗄️ 数据库接入 | **100+**(database-lookup 统一接入 78 个) |
| 📅 创建 | 2025-10(约 7 个月) |
| 📋 开放 Issues | 32 |
技能分布
100+ 数据库接入 — 统一 API:
- 物理/天文:NASA、NIST、SDSS、SIMBAD、系外行星档案
- 地球/环境:USGS、NOAA、EPA、OpenWeatherMap
- 化学/药物:PubChem、ChEMBL、DrugBank、FDA、KEGG、ZINC、BindingDB
- 材料科学:Materials Project、COD
- 生物/基因组:UniProt、STRING、Ensembl、NCBI Gene、GEO、GTEx、PDB、AlphaFold 等
- 疾病/临床:COSMIC、Open Targets、ClinicalTrials.gov、OMIM、ClinVar、GDC/TCGA、cBioPortal
- 法规:FDA、USPTO、SEC EDGAR
- 经济/金融:FRED、World Bank、US Treasury
- 人口统计:US Census、Eurostat、WHO
70+ Python 包技能(优化过的用法):
RDKit、Scanpy、PyTorch Lightning、scikit-learn、BioPython、PennyLane、Qiskit、OpenMM、MDAnalysis、scVelo、TimesFM、deepchem、datamol、gget 等
9 个科研平台集成:
Benchling、DNAnexus、LatchBio、OMERO、Protocols.io、Open Notebook、LabArchives、Opentrons(实验室自动化)、Ginkgo Cloud Lab
30+ 分析与沟通:
文献综述、同行评审、科学写作、文档处理、海报、PPT、Mermaid 图表、infographic 生成
10+ 研究与临床:
假设生成、基金申请、临床决策支持、治疗方案、药物安全
真正的价值:Agent 从「能写代码」到「懂科研」
没有这些技能时,你给 Agent 说「用 RDKit 分析一下构效关系」,Agent 会:
1. 猜 RDKit 的 API(可能过时)
2. 写一段缺乏领域经验的代码
3. 不知道最佳实践和常见陷阱
有了技能文件后,Agent 直接读取经过验证的 SKILL.md,包含:
# database-lookup 技能摘录
## Database Selection Guide
用户问... | 查什么库
---|---
化合物结构 | PubChem
结合亲和力 | ChEMBL, BindingDB
药物标签 | FDA (OpenFDA), DailyMed
基因表达 | GEO, GTEx
癌症突变 | COSMIC, cBioPortal
临床试验 | ClinicalTrials.gov
配套桌面应用:K-Dense BYOK
同公司的开源项目(7K+ stars):
- 开源桌面 AI 协同科学家
- 自带 API key,40+ 模型可选
- 完整研究环境:网页搜索、文件处理、137 技能全部可用
- 数据保留在本地
- 可选 Modal 云端扩展重型计算
安全设计
- Cisco AI Defense Skill Scanner 集成扫描每个技能
- 每周安全扫描,结果在 SECURITY.md 更新
- 强烈建议:不要一次性安装全部,只装需要的
- 审阅 SKILL.md 后再使用社区贡献的技能
曾用名
"Claude Scientific Skills" → 更名消除 Claude 依赖,兼容任意 Agent Skills 标准实现。
项目关联
- 与 OpenClaw 的 Agent Skills 系统直接相关——这是我们完全对标的一套技能架构
- OpenClaw 目前有 28 个技能(见
/home/jay/clawd/skills/),而 K-Dense 有 137 个科研领域技能 - 值得学习的:database-lookup 统一接入 78 个数据库的设计模式、SKILL.md 的文档质量
- 同类项目对比:Matt Pocock Skills(25 个工程技能)vs Scientific Agent Skills(137 个科研技能)
- K-Dense BYOK 的"本地优先 + 可选云端"模式与 OpenClaw 的 Agent 架构思路接近
评分
| 维度 | 分数 | 说明 |
|---|---|---|
| 覆盖范围 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 137 技能,17 领域,100+ 数据库,极广 |
| 文档质量 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 每个 SKILL.md 都有详细文档+示例+最佳实践 |
| 易用性 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | npx / gh skill 一键安装 |
| 社区规模 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 21.9K stars,2.4K forks |
| 创新性 | ⭐⭐⭐⭐ | Agent Skills 标准正在成长,非原创标准但执行极好 |
| 关联度 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 直接对标 OpenClaw 技能系统 |
综合评分:4.8 / 5.0 — 目前最全面的开源科研 Agent 技能集合。对 OpenClaw 的 Agent Skills 生态有直接参考价值——database-lookup 的模式(统一接口 + 详细文档)尤其值得学习。
链接
- GitHub: https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
- 技能列表: https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/blob/main/docs/scientific-skills.md
- K-Dense BYOK: https://github.com/K-Dense-AI/k-dense-byok
- K-Dense 官网: https://k-dense.ai
- Agent Skills 标准: https://agentskills.io/
- 入门视频: https://youtu.be/ZxbnDaD_FVg
- X/Twitter: https://x.com/k_dense_ai